La migración, ha sido reconocida como fuente de diversas problemáticas sociales, demandando atención gubernamental bajo el marco de los derechos humanos. En este contexto, los estudiantes migrantes transnacionales, que transitan entre México y Estados Unidos, acumulan experiencia escolar en ambos países y forman una nueva población dentro del sistema educativo mexicano, apelando atención especial por sus características particulares, que reflejan las complejidades y desafíos derivados de su experiencia migratoria y escolar. Esta investigación se desarrolla a través de una metodología cualitativa, primero, valora el diseño e implementación del Programa Binacional de Educación Migrante (PROBEM) y luego analiza el cumplimiento del derecho a la educación de la población migrante transnacional desde la interpretación de las percepciones sobre la asequibilidad y accesibilidad, con el objetivo de formular una propuesta de rediseño del programa para fortalecer el cumplimiento del derecho a la educación desde un Enfoque Basado en Derechos Humanos (EBDH) para la población estudiantil migrante transnacional inscrita en escuelas secundarias de Atotonilco el Grande e Ixmiquilpan, Hidalgo. Los resultados señalan un fuerte vínculo entre el diseño y la implementación, revelando fallos de diseño, como, la ausencia de un diagnóstico del problema, impidiendo la focalización y cuantificación de la población objetivo y la identificación de actores, limitando la implementación. Se identifican obstáculos en el derecho a la educación, causados por; personal no capacitado, problemas de aprendizaje por el desconocimiento de términos académicos en español, barreras para ingresar a las escuelas y situaciones de discriminación e inequidad. La investigación, sugiere estrategias fundamentadas en el EBDH, enfocadas, no, en las necesidades de los estudiantes, sino, en el cumplimiento de su derecho a la educación. En conclusión, se reconoce la pertinencia del PROBEM, así como la necesidad de fortalecerlo para garantizar el cumplimiento efectivo del derecho a la educación, por lo que, es esencial inyectar racionalidad al programa, a través de un diagnóstico sólido del problema y una revisión exhaustiva del diseño del programa, que favorezca un enfoque incremental, flexible y adaptativo para enfrentar los desafíos y adaptarse a las necesidades cambiantes de la población migrante.