La guanábana (annona muricata) es un fruto al cual se le atribuyen compuestos bioactivos (compuestos fenólicos y acetogeninas) relacionados a la prevención de enfermedades no transmisibles. Este es consumido usualmente como jugos y néctares, no obstante, el proceso para su conservación (pasteurización) produce cambios en color, olor, textura y sabor, así como sus propiedades nutricionales, por ello se busca la implementación de tecnologías emergentes, como la termoultrasonicación (TUS), el cual evita mínimas alteraciones en las propiedades fisicoquímicas, propicia la retención de nutrientes, la liberación de compuestos bioactivos y genera inocuidad. El objetivo del presente trabajo fue determinar la condición óptima de TUS sobre las propiedades microbiológicas, fisicoquímicas, enzimáticas y antioxidantes del néctar de guanábana mediante la metodología de superficie de respuesta y su comparación con néctar pasteurizado sobre la bioaccesibilidad in vitro de antioxidantes.