La Colitis Ulcerosa Crónica Idiopática (CUCI) es una Enfermedad Inflamatoria Intestinal (EII) de etiología desconocida. Sin embargo, se ha asociado con la interacción de factores ambientales, inmunológicos y genéticos. Polimorfismos y una menor expresión del gen de Resistencia a Múltiples Fármacos 1 (MDR1) se ha asociado con el desarrollo de la CUCI y con la resistencia a fármacos empleados en el tratamiento de dicha enfermedad. La glucoproteína P (P-gp), el producto de MDR1 pertenece a la familia de las proteínas de unión a ATP (ABC), la cual, está compuesta de 1280 aminoácidos con 6 dominios transmembranales, se expresa en células como el hepatocito y enterocito. El objetivo de esta investigación es cuantificar la expresión de MDR1 y su relación con las variables clínicas en biopsia intestinal de pacientes con CUCI y controles normales. Se realizó un estudio de casos controles compuestos por 2 grupos: pacientes con CUCI dividido en pacientes con actividad (n=11) y pacientes en remisión (n=11) y un grupo control (n=12). Como grupo control se eligieron individuos que en el estudio de colonoscopía presentaban características normales de la mucosa sin datos de inflamación. Se tomó una biopsia para hacer la extracción de RNA m total y posteriormente se realizó la síntesis del ADN c mediante transcripción reversa. El análisis de expresión del gen MDR1 e IL-6 se realizó por Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) tiempo real. Los resultados se analizaron por pruebas de U de Mann-Whitney, Kruskal-Wallis y correlación de Spearman, tomando como valor significativo un valor de p<0.05. Se determinó que la expresión del gen MDR1 disminuye en pacientes con CUCI en actividad en relación al los grupos en remisión y control. Los niveles de expresión en pacientes en remisión también disminuyeron en relación al grupo control. Cuantificar los niveles de expresión del gen MDR1 puede ser un factor predictor de respuesta al tratamiento farmacológico y del curso clínico de pacientes con CUCI.