Las aguas termales son reservorios de microorganismos termófilos, es decir, que tienen la capacidad de crecer a elevadas temperaturas. Su importancia biotecnológica yace en los metabolitos que se pueden obtener de estos, por ejemplo, las enzimas termoestables, que se pueden aplicar en procesos industriales con condiciones extremas, coadyuvando en la reducción de sustancias tóxicas empleadas en estos procesos, por lo que se pueden reducir costos y al mismo tiempo, beneficiar al medio ambiente. La presente investigación versó sobre el agua termal del balneario de Santa María Amajac en el estado de Hidalgo, México. Se tomaron muestras de agua de dos pozos, Z1 y Z2, mismas que fueron caracterizadas fisicoquímicamente y analizadas desde un enfoque hidrogeoquímico con el propósito de comprender el papel que desempeñan los minerales en un entorno termal, particularmente en relación con los procesos de interacción agua- roca y su influencia en la presencia y actividad de comunidades bacterianas especializadas. Se aislaron siete cepas de Z1 y once de Z2. Las cepas se observaron al microscopio para comprobar su forma celular, tinción de Gram y capacidad de producir endosporas. La caracterización morfológica se realizó en medio sólido y líquido, se determinó su capacidad de tolerancia a diferentes rangos de temperatura, pH y concentraciones de NaCl. Se realizaron pruebas bioquímicas para verificar su potencial producción de enzimas de importancia industrial. Las cepas se identificaron por secuenciación del gen 16S rDNA por análisis en la base de datos GenBank y se construyó un árbol filogenético para soportar su identidad. Las cepas se asociaron con los géneros bacterianos Anoxybacillus, Bacillus , Aneurinibacillus , Paenibacillus y Deinococcus . Se seleccionaron las cepas presuntivas para la producción de xilanasas termoestables. Finalmente, se realizaron ensayos de cinéticas enzimáticas con la finalidad de evaluar el tiempo en el que se obtiene mayor actividad xilanolítica y reconocer las condiciones óptimas a pH alcalinos para comprobar su potencial aplicación en procesos industriales.