Se presenta el diseño de una guía farmacoterapéutica para la práctica odontológica de estudiantes y profesionales que laboran en el Instituto de Ciencias de la Salud de la Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo, a partir de la revisión de historias clínicas de pacientes atendidos en dicha institución, el período comprendido de julio a diciembre del 2019, con la finalidad de identificar las enfermedades sistémicas más frecuentes, las afecciones dentales que más se atienden, así como los medicamentos que más se utilizan en el instituto. Para estructurar la guía farmacoterapéutica, se realizó una revisión bibliográfica exhaustiva de los medicamentos más usados para las enfermedades que con mayor frecuencia son atendidas en esta institución, el objetivo de establecer las formas de presentación, su mecanismo de acción, las indicaciones, contraindicaciones, dosis, efectos adversos, interacciones, precauciones y conservación. Para recopilar toda la información necesaria para la guía farmacoterapéutica fueron consultadas, analizadas y evaluadas fuentes primarias, secundarias y terciarias tales como: artículos científicos odontológicos, artículos farmacéuticos, páginas web, base de datos de historias clínicas revisadas, textos de farmacología y de patología. Se identificaron como afecciones dentales más frecuentes atendidas: caries I y II, gingivitis y periodontitis, como antecedentes patológicos personales más frecuentes en este periodo: hipertensión arterial, diabetes y alergias atópicas, los medicamentos que más se utilizaron fueron, anestésicos locales, AINES y antibióticos. La guía farmacoterapéutica quedó conformada con información confiable y actualizada sobre dichos medicamentos lo que permitirá el manejo efectivo, seguro y racional en la práctica odontológica.