La enfermedad periodontal (EP) es un proceso inflamatorio multifactorial que causa la pérdida de la estructura de soporte de los dientes. Se considera aproximadamente en el mundo el 48% de la población adulta afectada por esta patología. La prevalencia varía según el entorno cultural, social, económico y político; En México es 70% y en el Estado de Hidalgo es 79.6-82.1%. En la última década se ha evidenciado un aumento de la enfermedad periodontal que puede atribuirse al envejecimiento de la población y a las enfermedades degenerativas como la Diabetes tipo 2. El presente estudio analiza su etiología, diagnóstico y tratamiento de EP, así como la relación con el micronúcleo (MN) y la apoptosis como biomarcadores de ADN y daño celular. Este diseño fue un estudio transversal, analítico y comparativo que utilizó una población de 33 pacientes de la Clínica de Periodoncia del Área Académica de Odontología de la ICSA desde el período enero-junio de 2015 para determinar factores socio-demográficos, hábitos y estado de salud, una encuesta fue respondida por los pacientes al inicio de la intervención, así como un examen periodontal para determinar el grado de EP y una colección de células exfoliadas de la mejilla interna de la cavidad oral, que se repitió al final. Se procesaron las muestras y se leyeron 1000 células por lámina; para los criterios de evaluación se tuvieron en cuenta los criterios de Bolognesi (2011). El análisis estadístico se realizó con el software estadístico STATA versión 12 con IC del 95%, analizando las variables de la encuesta, diagnóstico periodontal, MN y anormalidades nucleares antes y después del tratamiento. Los resultados mostraron una diferencia significativa en la mejora de los parámetros clínicos y el aumento de MN, el núcleo pignótico y las células en cariolisis. Concluyendo que el tratamiento de EP y MN tienen una relación entre ellos.