En este trabajo se presenta el estudio de la interacción de iones Ca2+ con antibióticos derivados de estreptomicina y con antagonistas de tipo dihidropiridínico mediante enfoques Docking y QSAR utilizando la Teoría de los Funcionales de la Densidad (DFT). En el Capítulo 1 se analizan las interacciones de los antibióticos Rhodoestreptomicina A (Rho A) y B (Rho B), tanto de sus formas neutras como protonadas y sus respectivos complejos formados frente a los iones H+ y Ca2+, tanto en fase gas como en fase solvente, a través de sus propiedades electrónicas y geométricas. Así mismo se presentan los resultados del Docking molecular entre los antibióticos Rho A y Rho B y iones de calcio hexahidratados. En el Capítulo 2 se presentan los resultados del estudio QSAR con cuarenta derivados de 1,4-dihidropiridinas para predecir la actividad biológica (log IC50) aplicando DFT, para el cálculo de los descriptores cuánticos. Para este estudio se utilizó el gradiente de densidad reducida (por sus siglas en inglés, RDG) como un parámetro innovador que describe las interacciones de puente de hidrógeno en estos sistemas. En el Capítulo 3 se realizó el diseño de un canal de calcio mediante homologación de un canal de potasio, utilizando dinámicas moleculares. Este canal funcionó como sitio receptor para los acoplamientos moleculares (Docking) con los derivados de 1,4-dihidropiridinas, determinando los sitios huésped-receptor a través de la constante de disociación, que permite relacionarla con la actividad biológica experimental.