Después de la remoción biológica, las aguas residuales se someten a una última limpieza por filtración en una capa de arena y se desinfecta. Pocos microorganismos patógenos quedan después de las etapas de tratamiento y filtración, pero las rigurosas normas de salud pública exigen que se desinfecten antes de verterlas en las corrientes naturales.