Algunos procesos físicos y químicos provocan alteraciones en la mineralogía y composición de los sedimentos. La estabilidad de varios minerales está determinada por diversos factores, tales como la energía libre de sus reacciones, el pH, la temperatura y la actividad de varios iones. La Geoquímica de rocas sedimentarias puede complementar datos petrográficos, especialmente cuando estos últimos resultan ser ambiguos.