El tratamiento de aguas residuales mediante métodos biológicos es de gran interés, ya que se considera una aplicación eficiente de la biotecnología para remediar sus efectos contaminantes. Sin embargo, se ha observado que los mejores rendimientos se obtienen utilizando consorcios microbianos, los cuáles no han sido caracterizados completamente, por lo que sólo se conocen algunas de las especies que pueden degradar colorantes. En este trabajo se estudió la interacción metabólica en cultivos mixtos de Trametes versicolor y Pseudomonas putida, durante la degradación del colorante rojo ácido 27. Se analizó la estructura del colorante que se pretende degradar a través de métodos computacionales para evaluar, con el fin de analizar los productos metabólicos que resulten de la degradación.