Predicción de actividad hidrolasa o transferasa en amilasas mediante modelos de lenguaje de proteínas.

Valencia García, Odeth Giovanna

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Campo DC	Valor	Lengua/Idioma
dc.contributor.author	Valencia García, Odeth Giovanna	-
dc.date.accessioned	2026-03-18T16:35:45Z	-
dc.date.available	2026-03-18T16:35:45Z	-
dc.date.issued	2025-11-04	-
dc.identifier.govdoc	IBIO TEC .16811 2025	-
dc.identifier.other	ATD1607	-
dc.identifier.uri	http://dgsa.uaeh.edu.mx:8080/bibliotecadigital/handle/231104/7600	-
dc.description	Las enzimas de la familia GH13, tradicionalmente clasificadas como hidrolasas, también incluyen miembros con actividad transferasa. Esta dualidad funcional plantea un reto en la predicción de su especificidad catalítica a partir de la secuencia primaria. En este trabajo se emplean modelos de lenguaje de proteínas (PLMs), particularmente ESM Cambrian (ESMC), junto con herramientas estructurales como AlphaFold2 y FoldMason, para predecir si una amilasa actuara como hidrolasa o transferasa. Se construyó un conjunto de datos no redundante de proteínas caracterizadas, se alinearon sus secuencias y estructuras, y se identificaron posiciones diferenciadoras mediante análisis estadísticos robustos. Los embeddings generados por ESMC fueron analizados mediante técnicas de reducción de dimensionalidad y clustering, revelando capas específicas del modelo capaces de separar las funciones enzimáticas. Asimismo, se identificaron residuos clave, tanto a nivel de secuencia como estructural, que podrían determinar la especificidad funcional. Este enfoque demuestra el potencial de los modelos de lenguaje y el análisis bioinformático integrado para predecir funciones enzimáticas con aplicaciones biotecnológicas y de diseño racional de proteínas.	es_ES
dc.language.iso	es	es_ES
dc.publisher	ICAp-BD-UAEH	es_ES
dc.subject	Amilasas	es_ES
dc.subject	Modelos de lenguaje de proteínas	es_ES
dc.subject	Aprendizaje profundo	es_ES
dc.subject	Biotecnología.	es_ES
dc.title	Predicción de actividad hidrolasa o transferasa en amilasas mediante modelos de lenguaje de proteínas.	es_ES
dc.title.alternative	Biotecnología.	es_ES
dc.type	Tesis	es_ES
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