Tagetes erecta o flor de cempasúchil es una planta de uso ornamental, considerado un cultivo de gran tradición desde la época prehispánica, actualmente se produce en varios estados de México, donde Hidalgo ocupa el tercer lugar. Las prácticas de cultivo corresponden a una selección dirigida de los mejores atributos de la flor, es por esto que la caracterización morfológica es importante para el aprovechamiento y mejoramiento de la especie. El objetivo del estudio fue analizar la variación morfológica de cempasúchil para determinar si existe un efecto asociado al manejo local en cultivares de Tula de Allende, Ixmiquilpan y Tlaxcoapan, Hidalgo. Las entrevistas hacia productores se sistematizaron con una clasificación de rangos, se realizó un análisis UPGMA, utilizando distancias de Gower a fin de delimitar los grupos; para identificar los atributos correspondientes al agrupamiento, se realizó un modelo de dos vías. Se contrastó el efecto del cultivo sobre tres variables categóricas y diez continuas de diez individuos por cultivar, tres cultivares por municipio, mediante un AFDG, comparando el método de cultivo como variable de agrupamiento. Una vez identificados los elementos exclusivos, se contrastaron las asociaciones entre atributos categóricos mediante una prueba de Chi cuadrada. Las variables con mayor significancia se utilizaron para un análisis de componentes principales con distancias euclidianas. Los resultados muestran que Capula, Ixmiquilpan forma un grupo consistente, principalmente por la siembra, deshierbe y rotación de los cultivos, correspondiendo a un manejo familiar. Existen diferencias morfológicas significativas entre los tipos de cultivo (F (23,66) = 9.4, p < 0.001), estas se explican por las variables AP, DT, NR, CF, DCF, LL, además de una interacción preferente entre EP-FL para uno de los tipos de manejo. En conclusión, una práctica intensiva permite una mayor variación morfológica del cultivo de cempasúchil, a pesar de una selección dirigida hacia plantas más grandes con flores densas.