Predicción de actividad hidrolasa o transferasa en amilasas mediante modelos de lenguaje de proteínas.

Valencia García, Odeth Giovanna

dc.contributor.author	Valencia García, Odeth Giovanna
dc.date.accessioned	2026-03-18T16:35:45Z
dc.date.available	2026-03-18T16:35:45Z
dc.date.issued	2025-11-04
dc.identifier.govdoc	IBIO TEC .16811 2025
dc.identifier.other	ATD1607
dc.identifier.uri	http://dgsa.uaeh.edu.mx:8080/bibliotecadigital/handle/231104/7600
dc.description	Las enzimas de la familia GH13, tradicionalmente clasificadas como hidrolasas, también incluyen miembros con actividad transferasa. Esta dualidad funcional plantea un reto en la predicción de su especificidad catalítica a partir de la secuencia primaria. En este trabajo se emplean modelos de lenguaje de proteínas (PLMs), particularmente ESM Cambrian (ESMC), junto con herramientas estructurales como AlphaFold2 y FoldMason, para predecir si una amilasa actuara como hidrolasa o transferasa. Se construyó un conjunto de datos no redundante de proteínas caracterizadas, se alinearon sus secuencias y estructuras, y se identificaron posiciones diferenciadoras mediante análisis estadísticos robustos. Los embeddings generados por ESMC fueron analizados mediante técnicas de reducción de dimensionalidad y clustering, revelando capas específicas del modelo capaces de separar las funciones enzimáticas. Asimismo, se identificaron residuos clave, tanto a nivel de secuencia como estructural, que podrían determinar la especificidad funcional. Este enfoque demuestra el potencial de los modelos de lenguaje y el análisis bioinformático integrado para predecir funciones enzimáticas con aplicaciones biotecnológicas y de diseño racional de proteínas.	es_ES
dc.language.iso	es	es_ES
dc.publisher	ICAp-BD-UAEH	es_ES
dc.subject	Amilasas	es_ES
dc.subject	Modelos de lenguaje de proteínas	es_ES
dc.subject	Aprendizaje profundo	es_ES
dc.subject	Biotecnología.	es_ES
dc.title	Predicción de actividad hidrolasa o transferasa en amilasas mediante modelos de lenguaje de proteínas.	es_ES
dc.title.alternative	Biotecnología.	es_ES
dc.type	Tesis	es_ES