Introducción: A finales de 2019, se identificó un nuevo coronavirus como la causa de un grupo de casos de neumonía en Wuhan, una ciudad en la provincia de Hubei, China. En febrero del 2020, la Organización Mundial de la Salud comunicó que el nuevo Coronavirus fue denominado SARS-CoV-2 y la enfermedad que provoca fue nombrada como enfermedad por Coronavirus 2019 (COVID-19). Objetivo: Identificar las alteraciones en los marcadores biológicos que tienen mayor asociación con la mortalidad por Covid-19 en los pacientes ingresados en el hospital ISSSTE Columba Rivera Osorio de Pachuca, Hidalgo; durante el periodo comprendido entre el 01 de junio al 31 de octubre de 2020. Metodología: Se desarrolló un estudio de tipo observacional, de cohorte prospectiva, analítico, en los pacientes hospitalizados por infección confirmada por SARS-CoV-2. Se estudiaron una cantidad total de 124 pacientes hospitalizados con diagnóstico de COVID-19 de los cuales fueron 31 recuperados y 93 fallecidos. Se realizó un análisis descriptivo de las variables de estudio estimando con medidas de tendencia central, frecuencias y porcentajes, para las variables cuantitativas y para variables cualitativas se usaron tablas de contingencia. Se calculó Razón de Momios para el cálculo de factores de riesgo. Se realizaron análisis bivariado y multivariado. Resultados: Las alteraciones de marcadores biológicos que tienen mayor asociación con mortalidad por COVID-19 permiten identificar que las variables que tuvieron una mayor asociación fueron Sexo (Hombre), Temperatura (Superior a 38°), Saturación de oxígeno (<90%) y Glucosa (>140 mg/dl). Conclusión: Se concluye que los principales factores de riesgo para mortalidad de COVID-19 en el hospital ISSSTE Columba Rivera Osorio de Pachuca, Hidalgo; durante el periodo comprendido entre el 01 de junio al 31 de octubre de 2020 fueron: ser hombre con saturación menor al 40% y glucosa superior a 140 mg/dl). Sin embargo, al ser solo la población de un hospital, es necesario contrastar la información con otros contextos similares.