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http://dgsa.uaeh.edu.mx:8080/handle/231104/5764| Título : | Identificación bioinformática de proteínas de membrana plasmática susceptibles a regulación epigenética por metilación mediada por la obesidad. |
| Otros títulos : | Nutrición |
| Autor : | Gutiérrez Calixto, Arlo Jesús |
| Palabras clave : | Bioinformática Epigenética Islas CpG Proteínas de membrana Obesidad |
| Fecha de publicación : | 1-jul-2022 |
| Editorial : | ICSa-BD-UAEH |
| Descripción : | La obesidad puede producir modificaciones en el epigenoma del organismo, induciendo cambios en la expresión de las proteínas celulares, como en las proteínas de membrana plasmática (PMP), que ejercen una actividad en los procesos celulares, como el transporte de nutrientes y la comunicación celular, entre otros, los cambios en su expresión pueden modificar su fisiología celular resultando en el desarrollo de diversas enfermedades. A pesar de su importancia no hay estudios que indiquen cuales son las PMP susceptibles a regulación epigenética por obesidad. Objetivo: Identificar las PMP, susceptibles a regulación epigenética como resultado de la obesidad, utilizando técnicas bioinformáticas con la finalidad de generar conocimiento que contribuya al tratamiento de esta enfermedad. Metodología: Para la realización de este trabajo se utilizaron diferentes bases de datos y softwares. Se realizó una búsqueda de PMP relacionadas con obesidad en UNIPROT. Con los genes correspondientes, se realizó un análisis de homología con BLAST. Las islas de dinucleótidos citosina-guanina (CpG), se identificaron con EMBOSS Cpgplot, METH PRIMER y GC-Profile2.0. Se analizaron los posibles efectos epigenéticos mediante una búsqueda bibliográfica en SCHOLAR GOOGLE. Las interacciones proteína proteína se determinaron con STRING, las rutas metabólicas con KEGG y finalmente se estableció la relación de las modificaciones epigenéticas y el desarrollo de las enfermedades relacionadas con la obesidad con la creación de diagramas de Venn. Resultados: Se encontraron 13 PMP relacionadas con la obesidad, las cuales participan en la formación del AMPc (ADCY3), metabolismo de lípidos (ADRB3, CD36, FFAR4, GNAS, LIPE), regulación de la saciedad, ingesta de alimentos y movimiento intestinal (CCKAR, GFRAL, LEPR, CNR1), homeostasis energética (MC3R, MC4R) y movimiento celular y ciliogénesis (WDPCP), mostrando una alta homología con proteínas de otras especies (≥ 99% de similitud). Todos los genes con excepción de MCR4 contienen islas CpG, lo que los hace susceptibles a la regulación epigenética. La revisión bibliográfica mostró que existe una regulación epigenética mediante la hiper o hipometilación, en el caso del gen ADCY3, esta regulación se relaciona con colitis ulcerosa, enfermedad inflamatoria intestinal y enfermedad de Crohn, en el caso 2 del gen CCKAR, con el asma, el gen GNAS se asocia al pseudohipoparatiroidismo, pseudopseudohipoparatiroidismo, heteroplasia ósea progresiva y osteoma cutis, en el gen LIPE se asocia a esteatosis hepática y resistencia a la insulina. Si bien, el gen MC4R no presentó islas CpG, si se encontraron reportes de regulación epigenética para este gen. El análisis de interacción proteica, rutas metabólicas y los diagramas de Venn mostraron que cambios en la expresión de las PMP que pueden provocar alteraciones celulares que se asocian a diversas patologías. Conclusión: Mediante el uso de herramientas bioinformáticas, se pudieron encontrar PMP susceptibles a la una regulación epigenética, las cuales, pueden afectar distintas rutas metabólicas afectando la función celular en diversos tejidos, lo que provoca el desarrollo de diversas enfermedades como obesidad, sobrepeso, hipertensión, diabetes mellitus, enfermedades cardiovasculares y resistencia a insulina. |
| URI : | http://dgsa.uaeh.edu.mx:8080/bibliotecadigital/handle/231104/5764 |
| ISSN : | LNUTR .14691 2022 |
| Aparece en las colecciones: | Tesis de Licenciatura |
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