Plataforma computacional para el descubrimiento de motifs en secuencias de ADN empleando técnicas de minería de patrones frecuentes.

Sobrevilla Solís, Víctor Ignacio

dc.contributor.author	Sobrevilla Solís, Víctor Ignacio
dc.date.accessioned	2023-01-26T18:27:26Z
dc.date.available	2023-01-26T18:27:26Z
dc.date.issued	2022-10-26
dc.identifier.govdoc	MCCAE .14792 2022
dc.identifier.other	AT26533
dc.identifier.uri	http://dgsa.uaeh.edu.mx:8080/bibliotecadigital/handle/231104/2876
dc.description	La computación ha logrado desarrollar diferentes herramientas con gran potencial que permiten a diversas áreas de aplicación descubrir conocimiento relevante que apoya la toma de decisiones es estos ámbitos. Un caso particular es la Biología, y específicamente, la especificación de motifs, los cuales permiten dar indicios sobre el comportamiento de organismos vivos. Este trabajo de tesis presenta el desarrollo de una plataforma computacional enfocada al descubrimiento de motifs utilizando algoritmos de minería de patrones frecuentes. Se propone el uso de este tipo de procedimientos debido a que consisten en buscar elementos recurrentes en grandes volúmenes de datos a través del manejo eficiente de estructuras de datos, reducción en el espacio de búsqueda o en el conteo de elementos. Para el desarrollo de la plataforma, se empleó una metodología que permitió una construcción gradual de ella, considerando cinco fases principales: Entrada de secuencias de ADN, Pre-procesamiento de datos, Análisis de datos biológicos, Estructuración de resultados y Despliegue de resultados. Para la creación de dicha plataforma, se utilizaron diferentes herramientas de codificación como HTML, CSS, JavaScript y Python. Con estas acciones se logró desarrollar una plataforma computacional web, la cual posee una interfaz sencilla, donde el usuario puede utilizar diferentes algoritmos para analizar de forma eficiente grupos de secuencias de ADN de alto volumen, con la finalidad de hallar sus respectivos patrones frecuentes y, posteriormente, el conjunto de motifs asociado a ese grupo de secuencias. La obtención de patrones frecuentes en este trabajo se realiza implementando una mejora en su identificación dentro de un grupo de secuencias. Para la obtención de motifs, se propone en esta investigación una nueva forma de búsqueda, comprobando experimentalmente que obtiene más motifs que otras estrategias reportadas en la literatura, empleando un menor tiempo.	es_ES
dc.language.iso	es	es_ES
dc.publisher	ICBI-BD-UAEH	es_ES
dc.subject	Motifs	es_ES
dc.subject	ADN	es_ES
dc.subject	Patrones frecuentes	es_ES
dc.subject	Minería de datos	es_ES
dc.subject	Minería de patrones frecuentes	es_ES
dc.subject	Ciencias en Computación Avanzada y Electrónica	es_ES
dc.title	Plataforma computacional para el descubrimiento de motifs en secuencias de ADN empleando técnicas de minería de patrones frecuentes.	es_ES
dc.title.alternative	Ciencias en Computación Avanzada y Electrónica.	es_ES
dc.type	Tesis	es_ES